在星穹铁道第二章主线任务中，主要目标包括调查银河之力记忆中的空白部分，寻找银河铁道危害源，寻找并恢复列车中心控制系统的处理能力，最终确定银河铁道相关人的身份，并找出幕后操作者的阴谋。

在星穹铁道第二章主线任务中，主要角色包括：列车长「长光」、代理列车长「赫罗」、星穹列车机械师「黑塔」、旅人「三月」、列车守望者「刃」等，以及第二章主线任务中新增的角色，如银河铁道危害源的幕后操作者「千之刃」和他的助手「七之羽」等。

在星穹铁道第二章主线任务中，主要的挑战和困难包括：银河之力记忆中的空白部分调查困难、银河铁道危害源的强大和难以控制、列车中心控制系统的复杂性和修复难度、银河铁道相关人的身份确认、幕后操作者的神秘和身份不明、以及主角团成员自身的成长和抉择等。

在星穹铁道第二章主线任务中，主要的转折和惊喜包括：银河之力记忆中的空白部分被揭示、银河铁道危害源被揭露的真实身份、列车中心控制系统的修复成功、银河铁道相关人的身份确认、幕后操作者的揭露、以及主角团成员自身能力的发展和成长的变化等。

在星穹铁道第二章主线任务的结局中，银河之力记忆中的空白部分被修复，银河铁道危害源被清除，列车中心控制系统被修复，银河铁道相关人的身份确认，幕后操作者的阴谋被揭露，并且主角团成员自身能力得到了发展和成长，最终成功保护了星穹列车和旅人的安全。