序章：自由之城

主角尼科·贝里克，一位来自东欧的难民，来到自由城寻找他的表弟罗曼。罗曼声称自己在自由城发了大财，但尼科很快发现这只是一个骗局。

尼科被卷入了一系列危险的事件中，涉及到黑帮、腐败警官和俄罗斯黑手党。他无法向当局求助，只能靠自己的力量在自由城中生存下去。

第一章：俄罗斯洋基帮

尼科加入了俄罗斯洋基帮，由弗拉基米尔·格雷格洛维奇领导。他执行了一系列任务，包括破坏竞争对手帮派和暗杀目标。

然而，尼科逐渐意识到格雷格洛维奇的阴险本质。当他发现格雷格洛维奇计划杀死罗曼时，他背叛了帮派，与罗曼联手对抗格雷格洛维奇。

第二章：小意大利黑帮

尼科与小意大利黑帮老大吉米·佩戈里诺联系，寻求报复格雷格洛维奇。佩戈里诺是一个贪婪且残忍的人，他利用尼科为自己牟利。

尼科对佩戈里诺的行事方式越来越感到不安。当他发现佩戈里诺打算背叛自己时，他杀死了佩戈里诺，并从他的帮派中脱身而出。

第三章：西班牙人帮

尼科与西班牙人帮老大雷·博奇诺联系，希望在自由城建立自己的一块领地。博奇诺是一个足智多谋且雄心勃勃的人，他帮助尼科建立了他的犯罪帝国。

然而，博奇诺与俄罗斯黑手党 Boss 雷斯托维奇结盟，尼科逐渐意识到博奇诺的野心。当博奇诺打算背叛自己时，尼科与埃德温·普罗恩合作，一起击败了博奇诺。

第四章：结局

尼科终于报复了格雷格洛维奇，摧毁了俄罗斯黑手党在自由城的影响力。然而，他的胜利是苦涩的，因为他在过程中失去了许多朋友和盟友。

尼科决定离开自由城，开始新的生活。他意识到自由城是一个无情且腐败的地方，他无法在这样的环境中实现他的梦想。