瘟疫的初始来源尚不清楚，但有几种主要理论：动物源、环境源和人畜共患源。动物源理论认为瘟疫最初来自动物，可能是啮齿类动物或鸟类，通过跳蚤或其他媒介传播给人类。环境源理论认为瘟疫最初来自土壤或水源中的细菌，而人畜共患源理论认为瘟疫最初是通过动物传播给人类，然后再在人与人之间传播。

黑死病是由鼠疫杆菌引起的，这是一种由啮齿类动物携带的细菌。鼠疫杆菌通过跳蚤叮咬传播，跳蚤因吸食感染动物的血液而携带细菌。黑死病是一种高度致命的疾病，在中世纪造成了数千万人的死亡。

天花病毒是一种痘病毒，起源于非洲啮齿类动物。天花最初在非洲传播，通过密切接触在人与人之间传播。天花是一种高度致命的疾病，留下疤痕，并可能导致失明或瘫痪。通过大规模疫苗接种运动，天花在 1980 年被根除，成为第一个被消灭的人类疾病。

埃博拉病毒是一种丝状病毒，起源于非洲蝙蝠。埃博拉病毒通过接触受感染动物的血液或体液传播，然后在人与人之间通过密切接触传播。埃博拉病毒是一种高度致命的疾病，没有已知的治愈方法。埃博拉病毒爆发经常发生在中非和西非。

寨卡病毒是一种黄病毒，起源于非洲的猴子。寨卡病毒通过蚊子叮咬传播，然后在人与人之间通过密切接触传播。寨卡病毒通常会导致轻度症状，但它与孕妇严重的出生缺陷有关。寨卡病毒爆发在美洲发生，包括巴西和哥伦比亚。

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